Департамент транспорта Сахалинской области является областным органом исполнительной власти Сахалинской области, основной целью деятельности которого является создание благоприятных условий для функционирования и развития организаций транспорта, в том числе морских торговых и рыбных портов и дорожного хозяйства, независимо от форм собственности, находящихся на территории Сахалинской области, а также координация их деятельности.