Законом закрепляются отношения, возникающие между субъектами инновационной деятельности и органами государственной власти Магаданской области при разработке, принятии и реализации инновационной политики Магаданской области и региональных целевых инновационных программ и инновационных проектов. Таким образом, создается единое правовое поле, единые принципы и экономические основы осуществления инновационной деятельности в Магаданской области.
Для взаимодействия органов государственной власти Магаданской области, научных организаций и других субъектов инновационной деятельности с целью координации работы по созданию региональной инновационной системы, при губернаторе Магаданской области образован Координационный совет по инновационной деятельности. В его состав входят ученые, специалисты, руководители органов исполнительной власти Магаданской области, промышленных и научных организаций, предприятий малого и среднего предпринимательства.
Финансирование инновационной деятельности осуществляется за счет средств областного бюджета, в рамках областной целевой инновационной программы, внебюджетных и иных источников.