Основными задачами Комиссии являются: координация деятельности государственных и коммерческих организаций в области погрузочно-разгрузочных работ с нефтепродуктами наливом, включая бункеровку в Санкт-Петербурге, на акватории Невской губы и Финского залива; повышение безопасности мореплавания и судоходства на акватории Морского порта Санкт-Петербург и внутренних водных путях в границах Санкт-Петербурга. Утверждено Положение о Комиссии.