Источником образования средств Фонда являются денежные средства разовых платежей за право пользования недрами по итогам проведения аукциона (конкурсов) по нефтяным и газовым месторождениям Республики Саха (Якутия). Собственником средств Фонда является Правительство Республики Саха (Якутия), а распорядителем средств Фонда - Министерство финансов Республики Саха (Якутия).