Департамент является исполнительным органом государственной власти Ульяновской области, осуществляющим функции по выработке региональной политики, нормативного правового регулирования, а также правоприменительные функции и функции по контролю и надзору в сфере ветеринарии.

Департамент реализует на территории Ульяновской области единую государственную политику в сфере ветеринарии, в том числе: участвует в реализации федеральных мероприятий на территории Ульяновской области, обеспечивает защиту населения от болезней, общих для человека и животных, за исключением вопросов, решение которых отнесено к ведению Российской Федерации, регистрирует специалистов в области ветеринарии, занимающихся предпринимательской деятельностью на территории Ульяновской области, контролирует деятельность специалистов в области ветеринарии.