Министерство здравоохранения Оренбургской области является органом исполнительной власти Оренбургской области и обеспечивает проведение в Оренбургской области государственной политики в сфере охраны здоровья граждан, а также исполняет отдельные полномочия Российской Федерации в области охраны здоровья граждан.

Положением указываются полное и сокращенное наименование министерства, его местонахождение, основные задачи, права функции.

Министерство возглавляет министр здравоохранения Оренбургской области, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Губернатором Оренбургской области. Структурными подразделениями Министерства являются управления и отделы, действующие на основании положений, также в целях рассмотрения наиболее важных вопросов деятельности министерства образуется коллегия, являющаяся совещательным органом, состав которой утверждается Губернатором Оренбургской области.