Разъясняется, что при пользовании водными объектами, расположенными на территории двух и более субъектов РФ, 60% платы вносится в бюджет субъекта РФ по месту регистрации плательщика с последующим их распределением между бюджетами тех субъектов РФ, на территории которых находятся такие водные объекты. При этом доля поступлений сумм платы в бюджет соответствующего субъекта РФ определяется бассейновыми соглашениями между субъектами РФ.
При пользовании водными объектами, находящимися на территории одного субъекта РФ, плата в полном объеме зачисляется на счета органов федерального казначейства по месту водопользования.