В Министерстве здравоохранения Республики Алтай организована работа Функционального проектного офиса.

Функциональный проектный офис Министерства здравоохранения Республики Алтай - координационный орган, обеспечивающий координацию мероприятий реализации проектного управления в Министерстве. Основными задачами Функционального проектного офиса являются: обеспечение организационно-методического руководства при осуществлении проектной деятельности в Министерстве; обеспечение координации действий по реализации проектов; обеспечение повышения результативности и эффективности реализации проектов; решение конфликтных ситуаций, возникающих в рамках взаимодействия участников проектов; контроль реализации проектов, формирование сводной отчетности по проектам Министерства; обеспечение обучения сотрудников Министерства знаниям и навыкам в области проектного управления. Функциональный проектный офис Министерства возглавляет руководитель - министр экономического развития и туризма Республики Алтай. Заседания проводятся по мере необходимости, но не реже одного раза в месяц. Решения Функционального проектного офиса Министерства обязательны для исполнения сотрудниками Министерства и членами рабочих групп, созданных для реализации проектов, координируемых Министерством.