Комитет ветеринарии с Госветинспекцией Республики Алтай осуществляет переданные полномочия Российской Федерации в области ветеринарии по установлению и отмене ограничительных мероприятий (карантина) на территории Республики Алтай. В структуру входят: председатель Комитета, заместитель, осуществляющий переданные полномочия, заместитель по ветеринарной экспертизе, отдел противоэпизоотических мероприятий, отдел экспертиз и бухгалтерия.