Госпитальный совет создан в целях выполнения функций Министерством здравоохранения Республики Алтай по реализации государственной политики в сфере здравоохранения, повышению качества и доступности медицинской помощи населению Республики Алтай, упорядочению взаимодействия деятельности амбулаторно-поликлинического звена, скорой и неотложной медицинской помощи, стационарной медицинской помощи, оказываемой медицинскими организациями населению.

Госпитальный совет действует на общественных началах. Основной задачей совета является организация взаимодействия деятельности медицинских организаций по госпитализации больных в стационары круглосуточного наблюдения с целью эффективного использования ресурсов здравоохранения. Решения Госпитального совета имеют рекомендательный характер.