Департамент территориальных органов исполнительной власти определен уполномоченным органом исполнительной власти по подготовке и проведению в Москве Всероссийской переписи населения.
На Департамент возложены функции главного администратора доходов бюджета города в части поступлений субвенций из федерального бюджета на осуществление переданных полномочий. Префектуры административных округов являются главными распорядителями бюджетных средств по расходам, осуществляемым за счет субвенций из федерального бюджета на выполнение указанных функций.
Префектурам поручено представлять в Департамент территориальных органов исполнительной власти заявку на перечисление субвенций и ежеквартальный отчет об осуществлении переданных полномочий. Департамент на основании представляемых материалов направляет в Федеральную службу государственной статистики сводную заявку на перечисление субвенций и сводный ежеквартальный отчет об осуществлении переданных полномочий.