Командировки Мэра, его первых заместителей, министров, префектов и руководителей органов исполнительной власти города оплачиваются за счет и в пределах средств, предусмотренных на эти цели по бюджетным сметам на содержание аппаратов на очередной год. Командировки сотрудников службы охраны Мэра оплачиваются за счет единой бюджетной сметы на содержание Аппарата Мэра и Правительства Москвы.
С 1 июля 2009 г. для высших чиновников вводятся надбавки к суточным в иностранной валюте. Для Мэра Москвы надбавка составляет 45%, для первого заместителя Мэра в Правительстве Москвы, заместителя Мэра в Правительстве Москвы, руководителя Аппарата Мэра и Правительства Москвы - 40%, для министра, префекта, руководителя органа исполнительной власти города - 35%.
Также этим чиновникам возмещаются фактические расходы по найму жилья, расходы на проезд в период командировки по тарифам 1-го класса, оплачиваются услуги залов официальных лиц и делегаций. Заместителю руководителя Аппарата Мэра и Правительства Москвы, руководителю Департамента внешнеэкономических и международных связей, руководителю Пресс-службы Мэра и Правительства Москвы, пресс-секретарю Мэра Москвы, сотрудникам службы охраны при служебных командировках за рубеж возмещаются расходы по проезду по тарифам 1-го класса, оплачиваются услуги залов официальных лиц и делегаций.