Новый закон допускает, чтобы по ходатайству Генерального прокурора РФ или его заместителя уголовные дела по некоторым статьям Уголовного кодекса России (о преступлениях террористического и экстремистского характера) отдавались на рассмотрение в окружной (флотский) военный суд по месту совершения преступления. Это возможно в случаях реальной угрозы безопасности участников судебного разбирательства и их близких.