Управлять имуществом научных организаций поручено специально созданному федеральному агентству.
Определены полномочия и порядок деятельности Федерального агентства научных организаций (ФАНО России).
На Агентство возложены функции и полномочия собственника федерального имущества, закрепленного за организациями, находившимися в ведении государственных академий наук до их реорганизации. Оно управляет имуществом этих организаций. Агентство также вправе осуществлять нормативно-правовое регулирование в сфере организации их деятельности, в том числе в области науки, образования, здравоохранения и агропромышленного комплекса.
К полномочиям Агентства отнесено утверждение программ развития подведомственных научных организаций и госзаданий на проведение ими фундаментальных и поисковых научных исследований. Оно также оценивает эффективность их работы (в том числе с экономической стороны).
В то же время Агентство не вправе осуществлять в установленной сфере деятельности контроль и надзор (кроме случаев, предусмотренных указами Президента РФ и постановлениями Правительства РФ).
Для координации взаимодействия Агентства и подведомственных ему научных организаций с Российской академией наук будет создан научно-координационный совет. В него войдут ученые, проводящие научные исследования на общепризнанном мировом уровне.
Работой Агентства руководит Правительство РФ. Оно же назначает главу Агентства по согласованию с Президентом РФ.
Определены полномочия руководителя Агентства. Он вправе представлять в Правительство РФ предложения о создании, реорганизации и ликвидации подведомственных научных организаций с учетом позиции Российской академии наук.