Согласно Протоколу применять тарифные льготы при ввозе товаров можно и в случаях, не указанных в Соглашении о едином таможенно-тарифном регулировании от 25 января 2008 г. Для этого необходимо решение Комиссии таможенного союза.
Тарифные льготы, предоставляемые в отношении товаров, ввозимых на территории государств-сторон или единую территорию государств-участников таможенного союза в рамках Европейского экономического сообщества, применяются независимо от страны их происхождения.
В связи с ратификацией протокола потребуется внести изменения в некоторые акты. Так, из Закона о таможенном тарифе нужно исключить норму, согласно которой Правительство РФ предоставляет тарифные льготы.