Вместо МВД функционирование системы воинского учета будет обеспечиваться Федеральной миграционной службой. В частности, территориальные органы ФМС России при регистрации или снятии с регистрационного учета граждан по месту жительства уполномочены выявлять граждан, обязанных состоять, но не состоящих на воинском учете, сообщать о них в соответствующие военные комиссариаты и (или) органы местного самоуправления, осуществляющие воинский учет. В этих целях должностные лица территориальных органов ФМС РФ будут проверять наличие в паспортах граждан отметок об отношении их к воинской обязанности и направлять граждан в соответствующие военные комиссариаты или органы местного самоуправления для постановки на воинский учет. При замене паспортов территориальные органы ФМС и военные комиссариаты будут производить отметки об отношении граждан к воинской обязанности.
При этом порядок организации совместной работы территориальных органов Федеральной миграционной службы и военных комиссариатов по вопросам обеспечения функционирования системы воинского учета будет определяться совместно Минобороны России и ФМС России.