Изменениями предусматривается перенос начала реформы местного самоуправления с 1 января 2006 года на 1 января 2009 года. В течение указанного переходного периода законами субъектов РФ может определяться порядок решения вопросов местного значения вновь образованных поселений, а также возможность решения вопросов местного значения вновь образованных поселений органами местного самоуправления муниципального района.

С 1 января 2006 г. до окончания переходного периода положения Федерального закона Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации" могут применяться в полном объеме.

При формировании и утверждении проектов бюджетов муниципальных районов на 2006-2008 годы средства районных фондов финансовой поддержки поселений могут распределяться с использованием показателей фактических доходов и расходов за отчетный период или прогнозируемых на плановый период доходов и расходов бюджетов поселений.

Изменен порядок распределения дотаций из региональных фондов финансовой поддержки муниципальных районов (городских округов). В переходный период до регистрации права собственности федеральные и региональные органы государственной власти вправе безвозмездно использовать имущество, переданное им для исполнения полномочий. В связи с этим внесены соответствующие изменения в бюджетное и налоговое законодательство.

Федеральный закон вступает в силу со дня его официального опубликования, за исключением отдельных норм, вступающих в силу с 1 января 2006 г., но не ранее одного месяца со дня официального опубликования.