Налоговый агент не обязан удерживать и перечислять НДФЛ при выплате аванса
Письмо Федеральной налоговой службы от 15 января 2016 г. № БС-4-11/320 “О рассмотрении обращения”
В силу НК РФ налоговые агенты обязаны перечислять суммы исчисленного и удержанного налога не позднее дня, следующего за днем выплаты налогоплательщику дохода.
Налоговый агент исчисляет, удерживает и перечисляет в бюджет НДФЛ с зарплаты (в том числе за первую половину месяца) один раз в месяц при окончательном расчете дохода работника по итогам каждого месяца, за который был начислен доход, в сроки, установленные НК РФ.
Организация - налоговый агент не обязана удерживать и перечислять НДФЛ при выплате аванса.