НК РФ не предусматривает ограничений в отношении вычета НДС, оплаченного за счет субсидий из областного бюджета
Если по итогам налогового периода сумма вычетов по НДС превышает общую сумму этого налога по операциям, признаваемым объектом обложения, то полученная разница возмещается (зачитывается, возвращается).
Вычетам подлежат суммы НДС по товарам (работам, услугам), имущественным правам, приобретенным для осуществления операций, облагаемых этим налогом. Причем НК РФ не устанавливает ограничений в отношении вычета НДС, оплаченного за счет субсидий из областного бюджета.