Если муниципальный контракт заключается с плательщиками, применяющими УСН, его цена не уменьшается на НДС
Организации и ИП, применяющие УСН, реализуют товары (работы, услуги) без учета НДС.
Государственный (муниципальный) контракт заключается по цене, предложенной победителем открытого аукциона в электронной форме. Это не зависит от применяемой системы налогообложения.
В документации о названном аукционе отражается начальная (максимальная) цена. Заказчик устанавливает, учитывать ли расходы на перевозку, страхование, уплату таможенных пошлин, налогов и других обязательных платежей или нет.
Следовательно, при заключении муниципального контракта с плательщиками, применяющими УСН, его цена не уменьшается на сумму НДС. При этом поставленные товары (выполненные работы, оказанные услуги) оплачиваются по цене, указанной в контракте.