Минфин России в письме от 26 августа 2011 г. N 03-03-06/1/521 разъяснил, что подписанный ЭЦП электронный документ, составленный по установленным форматам, может быть подан в налоговую в электронном виде.

Так, документ, оформленный в электронном виде и подписанный квалифицированной электронной подписью (ЭЦП), может являться документом, подтверждающим расходы, осуществленные налогоплательщиком, если законодательством не установлено требование о его составлении на бумажном носителе.

Если истребуемые у налогоплательщика электронные документы составлены по установленным форматам, он вправе направить их в налоговый орган в электронной форме по телекоммуникационным каналам связи, разъяснено в письме. Порядок направления требования о представлении документов, а также их представления в электронном виде установлен приказом ФНС России от 17 февраля 2011 г. N ММВ-7-2/168@.

В случае, если документ составлен не по установленным форматам, он подается на бумажном носителе в виде заверенной налогоплательщиком копии с отметкой о его подписании квалифицированной электронной подписью (ЭЦП).

Вот как прокомментировал новость Алексей Пауков, директор компании "Электронный экспресс" - одного из лидеров рынка электронной подписи: "До появления утвержденных электронных форматов всех основных первичных документов (акты, накладные и т.п.) останется необходимость дублировать документы в бумажной форме. Это будет сдерживающим фактором для перевода документооборота в электронную форму. Насколько быстро появятся такие форматы, сложно прогнозировать. Например, по электронным счетам-фактурам, появление которых анонсировано еще в начале года, форматы еще не утверждены. Мы строго относимся к необходимости соблюдения закона, поэтому не можем себе позволить выдать неутвержденное решение за готовое к применению. Пользователи системы "ГАРАНТ Электронный Экспресс" получат возможность обмениваться электронными счетами-фактурами, когда для этого появятся все законные основания".