Федеральная налоговая служба в соответствии с письмом Минфина России от 12.04.2016 № 03-05-05-04/20850 рассмотрела обращение по вопросу применения нормы подпункта 4 пункта 2 статьи 358 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) и сообщает следующее.

Согласно постановлению Правительства Российской Федерации от 30.06.2004 № 329 «О Министерстве финансов Российской Федерации» федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим функции по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере налоговой деятельности, является Министерство финансов Российской Федерации. Согласно пункту 1 статьи 34.2 Кодекса Минфин России дает письменные разъяснения по вопросам применения законодательства Российской Федерации о налогах и сборах.

Письмами Минфина России от 02.04.2015 № 03-05-04/18317 и от 10.04.2015 № 03-05-04-04/20422 даны разъяснения о том, что при подтверждении в указанном выше порядке факта осуществления организацией или индивидуальным предпринимателем пассажирских и (или) грузовых перевозок, все зарегистрированные на налогоплательщика находящиеся в собственности пассажирские и грузовые морские, речные суда не являются в силу подпункта 4 пункта 2 статьи 358 Кодекса объектом налогообложения по транспортному налогу.

Аналогичное мнение по вопросу применения подпункта 4 пункта 2 статьи 358 Кодекса имеют судебные органы, в частности, ВАС РФ от 21.07.2009 № 3513/09, ВАС РФ от 12.02.2013 № 11418/12.