ФНС России разъяснила порядок подачи расчета по форме 6-НДФЛ для таких ИП, которые как плательщики УСН стоят на учете в налоговой по месту жительства, а как плательщики ЕНВД – в инспекциях по месту нахождения каждой из торговых точек (письмо ФНС России от 1 августа 2016 г. № БС-4-11/13984@ "О направлении разъяснений по вопросам представления и заполнения расчета сумм налога на доходы физических лиц, исчисленных и удержанных налоговым агентом (форма 6-НДФЛ)"). Налоговики отметили, что расчет по форме 6-НДФЛ в отношении работников, нанятых в целях осуществления деятельности по УСН, нужно представить в налоговый орган по месту своего жительства. А в отношении доходов, выплачиваемых работникам, занятым в деятельности, в отношении которой применяется ЕНВД, – в налоговые органы по каждому месту учета ИП в связи с осуществлением такой деятельности.

Налоговая служба обосновала это тем, что по общему правилу доход, исчисленный и удержанный налоговым агентом-ИП у работника, уплачивается в бюджет по месту учета (то есть месту жительства, если речь об ИП) налогового агента в налоговом органе (п. 7 ст. 226 НК РФ). А ИП, которые используют ЕНВД, должны перечислять НДФЛ за своих работников в инспекцию по месту учета в качестве плательщика этого спецрежима (абз. 4 п. 7 ст. 226 НК РФ).

К слову, обязанность ИП на "вмененке" представить форму 6-НДФЛ в каждую из инспекций, в которых он состоит на учете, закреплена в п. 2 ст. 230 НК РФ.

ФНС России отдельно подчеркнула, что форма расчета заполняется по каждому ОКТМО отдельно (абз. 1, абз. 5 п. 1.10 раздела II Порядка заполнения и представления расчета по форме 6-НДФЛ). Поэтому ИП-налоговые агенты, которые состоят на учете по месту осуществления деятельности с применением ЕНВД, указывают код по ОКТМО по месту учета в связи с осуществлением такой деятельности, в отношении своих наемных работников – код по ОКТМО по месту своего учета в связи с осуществлением такой деятельности.