В соответствии с Правилами заполнения заявления о ввозе товаров и уплате косвенных налогов наименование товара отражается в нем на основании счета-фактуры или транспортных (товаросопроводительных) документов. Вместо перечня наименований конкретных товаров можно указать их общий вид (например, "мебель" вместо "столы письменные, кровати, кресла") в одной строке. При этом по ее графам отражаются сведения по всем товарам, отнесенным к одному виду. В частности, указываются реквизиты транспортных (товаросопроводительных) документов. Таким образом, ФНС России считает целесообразным для каждого товара указывать транспортные (товаросопроводительные) документы без ограничений по количеству.
Однако согласно Требованиям к составу и структуре информации в электронном виде об уплаченных суммах косвенных налогов в бюджеты государств-членов ТС для каждого товара, внесенного в заявление, можно указать только один транспортный (товаросопроводительный) документ. При этом если данные заявления на бумажном носителе будут отличаться от тех, что получены налоговым органом в рамках информационного обмена, то такие документы не будут являться основанием для подтверждения правомерности применения нулевой ставки НДС и (или) освобождения от уплаты акцизов.
В связи с изложенным региональным Управлениям Службы и ее Межрегиональным инспекциям по крупнейшим налогоплательщикам поручено обеспечить, чтобы в заявлениях, на которых налоговые органы проставляют отметку об уплате косвенных налогов (освобождении от НДС и (или) акцизов), в отношении одного товара отражался один транспортный (товаросопроводительный) документ.