Принят закон, согласно которому за исследовательскими корпоративными центрами – участниками научно-исследовательских проектов (п. 8 ст. 2 Федерального закона от 28 сентября 2010 г. № 244-ФЗ "Об инновационном центре "Сколково") с будущего года закреплен ряд преференций по уплате налогов и страховых взносов (Федерального закона от 28 декабря 2016 г. № 475-ФЗ "О внесении изменений в статью 105.14 части первой и часть вторую Налогового кодекса Российской Федерации"; далее – Закон № 475-ФЗ).

В частности, такие центры будут утрачивать право на освобождение от уплаты НДС только в определенных законом случаях. К ним относятся:

• утрата статуса участника проекта;
• достижение размера прибыли 1 млрд руб.;
• доходы от реализации взаимозависимым лицам товаров (работ, услуг), а также передачи имущественных прав составляют менее 50% от общей суммы доходов.

При наступлении данных случаев сумма НДС за год подлежит восстановлению и уплате в бюджет с взысканием с исследовательского корпоративного центра пени (п. 2.1 ст. 145.1 Налогового кодекса в редакции Закона № 475-ФЗ). Данное правило действует до 31 декабря 2021 года включительно (п. 2 ст. 4 Закона № 475-ФЗ).

При наступлении таких же случаев, как и при отмене льготы по НДС, центрам придется восстановить налог на прибыль, а также уплатить пеню (п. 3 ст. 246.1 НК РФ в редакции Закона № 475-ФЗ). Налоговая ставка по налогу на прибыль при этом составит 20% (п. 5.1 ст. 284 НК РФ в редакции Закона № 475-ФЗ).

Кроме того, такие центры освобождаются от уплаты налога на имущество (п. 20 ст. 381 НК РФ в редакции Закона № 475-ФЗ).

Добавим, что исследовательские корпоративные центры с будущего года также будут считаться участниками контролируемых сделок (подп. 8 п. 2 ст. 105.14 НК РФ в в редакции Закона № 475-ФЗ).