Федеральная налоговая служба рассмотрела письмо и в отношении представления уведомления о выборе налогового органа сообщает следующее.

Федеральным законом от 29.09.2019 N 325-ФЗ "О внесении изменений в части первую и вторую Налогового кодекса Российской Федерации" (далее - Федеральный закон N 325-ФЗ) внесены изменения, в частности, в пункт 7 статьи 226 и пункт 2 статьи 230 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс). Согласно пункту 3 статьи 3 Федерального закона N 325-ФЗ указанные изменения вступают в силу с 1 января 2020 года.

С учетом указанных изменений, налоговый агент - российская организация, имеющая несколько обособленных подразделений на территории одного муниципального образования, вправе перечислять удержанные суммы налога на доходы физических лиц (далее - НДФЛ) в бюджет по месту нахождения одного из таких обособленных подразделений, расположенных на территории одного муниципального образования, выбранному налоговым агентом самостоятельно, а также представлять в отношении работников этих обособленных подразделений по месту учета выбранного обособленного подразделения представления сведений о доходах физических лиц и суммах налога на доходы физических лиц по форме 2-НДФЛ (далее - справки по форме 2-НДФЛ) и расчета сумм налога на доходы физических лиц, исчисленных и удержанных налоговым агентом (форма 6-НДФЛ) (далее - расчет по форме 6-НДФЛ).

При этом налоговый агент обязан уведомить о выборе налогового органа не позднее 1-го числа налогового периода налоговые органы, в которых он состоит на учете по месту нахождения каждого обособленного подразделения.

Учитывая изложенное, организация - налоговый агент, имеющая несколько обособленных подразделений, находящихся на территории одного муниципального образования, вправе выбрать из этих обособленных подразделений только одно обособленное подразделение через которое будут перечисляться исчисленные и удержанные суммы НДФЛ, а также представляться справки по форме 2-НДФЛ и расчет по форме 6-НДФЛ.

В этой связи, организация вправе представить в налоговый орган в электронном виде либо на бумажном носителе одно уведомление о выборе налогового органа с указанием одного выбранного обособленного подразделения из всех обособленных подразделений, находящихся на территории одного муниципального образования. При этом уведомление о выборе налогового органа представляется в налоговый орган выбранного обособленного подразделения организации, через которое будут перечисляться исчисленные и удержанные суммы налога на доходы физических лиц, а также представляться справки по форме 2-НДФЛ и расчет по форме 6-НДФЛ. Дальнейшее уведомление всех налоговых органов, указанных в поле "Код налогового органа" раздела "Организация и ее обособленные подразделения, расположенные на территории одного муниципального образования:" уведомления о выборе налогового органа, будет осуществляться в автоматическом режиме.

Одновременно сообщается, что приказ ФНС России от 06.12.2019 N ММВ-7-11/622@ "Об утверждении формы Уведомления о выборе налогового органа, порядка заполнения и формата ее представления в электронной форме" находится на государственной регистрации в Министерстве юстиции Российской Федерации.