Вопрос: ООО применяет упрощенную систему налогообложения (далее - УСН) и является участником инновационного проекта "Сколково" (далее - резидент Сколково).

Организации, применяющие упрощенную систему налогообложения, не признаются налогоплательщиками налога на добавленную стоимость (п. 2 ст. 346.11 НК РФ в редакции до 01.01.2025).

Резидент Сколково имеет право на освобождение от обязанностей налогоплательщика НДС в течение десяти лет со дня получения статуса участника (п. 1 ст. 145.1 НК РФ).

Для резидентов Сколково, применяющих УСН, отдельных налоговых льгот законодательством не предусмотрено, т.е. ООО, являясь резидентом Сколково, является плательщиком единого налога при УСН.

Федеральным законом от 12.07.2024 N 176-ФЗ в ст. 145 НК РФ внесены изменения, согласно которым с 01.01.2025 налогоплательщики, применяющие УСН, признаются плательщиками НДС, если за предшествующий налоговый период сумма доходов превысила 60 млн рублей (п. 1 ст. 145 НК РФ в редакции Федерального закона от 12.07.2024 N 176-ФЗ).

По смыслу абзаца первого п. 2 ст. 145 НК РФ (в редакции Федерального закона от 12.07.2024 N 176-ФЗ) положения ст. 145 НК РФ не распространяются на резидентов Сколково. Но по смыслу абзаца второго п. 2 ст. 145 НК РФ резиденты Сколково, не отвечающие условиям абзацев третьего-пятого п. 1 ст. 145 НК РФ, все же являются плательщиками НДС.

Верны ли утверждения, что с 01.01.2025 правовое регулирование таково, что:

- резидент Сколково, применяющий УСН, является плательщиком НДС и вправе получить освобождение от обязанностей налогоплательщика НДС только в соответствии со ст. 145 НК РФ в случае соблюдения условий, предусмотренных абзацами третьим-пятым пункта 1 статьи 145 НК РФ;

- резидент Сколково, применяющий ОСНО, имеет право на освобождение от обязанностей налогоплательщика НДС в соответствии со ст. 145.1 НК РФ без дополнительных условий (в т.ч. предусмотренных п. 1 ст. 145 НК РФ)?

Ответ: В связи с обращением по вопросам применения организацией, получившей статус участника проекта по осуществлению исследований, разработок и коммерциализации их результатов в соответствии с Федеральным законом от 28 сентября 2010 г. N 244-ФЗ "Об инновационном центре "Сколково" и применяющей упрощенную систему налогообложения, освобождения от исполнения обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой налога на добавленную стоимость (далее соответственно - статус участника проекта "Сколково", УСН, НДС), Департамент налоговой политики сообщает.

С 1 января 2025 года вступили в силу положения Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс), согласно которым организации и индивидуальные предприниматели, применяющие УСН, признаются налогоплательщиками НДС. В связи с этим с 1 января 2025 года указанные организации и индивидуальные предприниматели НДС для уплаты в бюджет исчисляют в соответствии с положениями главы 21 "Налог на добавленную стоимость" Кодекса.

На основании пункта 1 статьи 145 Кодекса с 1 января 2025 года организации и индивидуальные предприниматели, применяющие УСН, освобождаются от исполнения обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой НДС, если за календарный год, предшествующий календарному году, начиная с которого организация или индивидуальный предприниматель переходит на УСН, либо за предшествующий налоговый период по налогу, уплачиваемому в связи с применением УСН, у указанных организации или индивидуального предпринимателя сумма доходов, определяемых в порядке, установленном Кодексом, не превысила в совокупности 60 млн рублей.

В соответствии с абзацем первым пункта 2 статьи 145 Кодекса если иное не предусмотрено данным пунктом статьи 145 Кодекса, положения статьи 145 Кодекса не распространяются на организации и индивидуальных предпринимателей, которые реализуют подакцизные товары в течение трех предшествующих последовательных календарных месяцев, а также на организации, указанные в статьях 145.1 и 145.2 Кодекса. При этом абзацем вторым пункта 2 статьи 145 Кодекса предусмотрено, что организации и индивидуальные предприниматели, указанные в абзацах третьем-пятом пункта 1 статьи 145 Кодекса, применяют освобождение от исполнения обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой НДС, без учета особенностей, предусмотренных абзацем первым пункта 2 статьи 145 Кодекса.

На основании пункта 1 статьи 145.1 Кодекса организация, получившая статус участника проекта "Сколково", имеет право на освобождение от обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой НДС, в течение десяти лет со дня получения ею статуса участника проекта "Сколково".

Таким образом, если у организации, получившей статус участника проекта "Сколково" и применяющей с 1 января 2025 года УСН, за календарный год, предшествующий календарному году, начиная с которого организация переходит на УСН, либо за предшествующий налоговый период по налогу, уплачиваемому в связи с применением УСН, сумма доходов, определяемых в порядке, установленном Кодексом, не превысила в совокупности 60 млн рублей, такая организация с 1 января 2025 года освобождается от исполнения обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой НДС, на основании статьи 145 Кодекса независимо от наличия у такой организации статуса участника проекта "Сколково".

В случае, если у указанной организации в течение налогового периода по налогу, уплачиваемому в связи с применением УСН, сумма доходов, определяемых в порядке, установленном Кодексом, превысит 60 млн рублей, такая организация начиная с 1-го числа месяца, следующего за месяцем, в котором имело место такое превышение, прекращает применять освобождение от исполнения обязанностей налогоплательщика НДС, предусмотренное статьей 145 Кодекса. При этом в указанном случае организация имеет право применить освобождение от исполнения обязанностей налогоплательщика НДС, установленное статьей 145.1 Кодекса.

Что касается организаций, получивших статус участника проекта "Сколково" и применяющих общую систему налогообложения, то такие организации применяют освобождение от обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой НДС, предусмотренное статьей 145.1 Кодекса, без учета особенностей, установленных для организаций, указанных в абзацах третьем-пятом пункта 1 статьи 145 Кодекса.

Настоящее письмо не содержит правовых норм или общих правил, конкретизирующих нормативные предписания, и не является нормативным правовым актом. В соответствии с письмом Минфина России от 7 августа 2007 г. N 03-02-07/2-138 направляемое письмо Департамента имеет информационно-разъяснительный характер по вопросам применения законодательства Российской Федерации о налогах и сборах и не препятствует руководствоваться нормами законодательства о налогах и сборах в понимании, отличающемся от трактовки, изложенной в настоящем письме.