Письмом ФНС России от 17 июля 2013 г. № АС-4-2/12722@ разъяснен порядок работы комиссий налоговых органов по легализации налоговой базы, а также критерии отбора налогоплательщиков, чья деятельность подлежит рассмотрению на их заседаниях.

Целью работы комиссий является увеличение поступлений налогов в бюджет путем побуждения налогоплательщиков к самостоятельному уточнению налоговых обязательств, недопущению нарушений налогового законодательства в последующих периодах. Они создаются при инспекциях и региональных управлениях ФНС России, при администрациях субъектов РФ и органах местного самоуправления.

Деятельность комиссии направлена на выявление в деятельности налогоплательщиков:

• неполного отражения в учете хозяйственных операций;
• отражения в налоговой и бухгалтерской отчетности недостоверных сведений;
• применения схем необоснованного возмещения налога на добавленную стоимость;
• отражения в налоговых декларациях по налогу на прибыль организаций необоснованных расходов (убытков);
• выплаты "теневой" заработной платы;
• несвоевременного перечисления НДФЛ;
• выявление работодателей, выплачивающих заработную плату ниже прожиточного минимума или минимального размера оплаты труда.

Отбор налогоплательщиков, чья деятельность подлежит рассмотрению на комиссии, осуществляется на основании анализа имеющейся информации об их финансово-хозяйственной деятельности по следующим группам:

• налогоплательщики, заявляющие налоговые убытки от осуществления финансово-хозяйственной деятельности;
• налогоплательщики, имеющие низкую налоговую нагрузку по налогу на прибыль организаций, акцизам, единому налогу, уплачиваемому при применении УСН, единому cельскохозяйственному налогу, НДФЛ, уплачиваемому индивидуальными предпринимателями.
• налогоплательщики, имеющие низкую налоговую нагрузку по НДС;
• налогоплательщики – индивидуальные предприниматели, заявившие профессиональный налоговый вычет в размере более 95% от общей суммы полученного за налоговый период дохода;
• налогоплательщики – индивидуальные предприниматели, отразившие в налоговых декларациях по НДС выручку от реализации, при этом в налоговой декларации по форме 3-НДФЛ заявившие доход, равный нулю, либо не представившие налоговые декларации по форме 3-НДФЛ за соответствующий период;
• налогоплательщики – физические лица, не задекларировавшие полученные доходы.

Также на заседание комиссии могут быть вызваны налогоплательщики – налоговые агенты:

• имеющие задолженность по перечислению НДФЛ;
• снизившие поступления НДФЛ относительно предыдущего налогового периода более чем на 10%;
• выплачивающие заработную плату ниже среднего уровня по видам экономической деятельности в регионе.

Кроме того, комиссии проверяют налогоплательщиков, в отношении которых есть информация о получении дохода, содержащаяся в обращениях контрольно-надзорных ведомств, граждан, организаций. Также изучаются сообщения в СМИ и Интернете.

Налоговый орган, принявший решение о вызове налогоплательщика для рассмотрения его деятельности на комиссии, письменно уведомляет должностных лиц налогоплательщика о принятом решении с указанием времени и места проведения заседания комиссии. По результатам рассмотрения деятельности информация можетбыть направлена в правоохранительные, контролирующие и иные уполномоченные органы. Также может быть назначена выездная налоговая проверка.