Целями осуществления контроля являются: соблюдение учреждениями требований правовых актов Российской Федерации и Ханты-Мансийского автономного округа - Югры, регулирующих вопросы их деятельности; обеспечение сохранности имущества автономного округа, находящегося в оперативном управлении учреждений и органов государственной власти автономного округа, оценка эффективности использования такого имущества.

Контроль за деятельностью учреждений осуществляется в части исполнения плана финансово-хозяйственной деятельности, выполнения государственного задания на оказание государственных услуг (выполнение государственных работ), соответствия деятельности их уставам, целевого использования средств бюджета автономного округа.

Контроль за деятельностью учреждений, а также контроль за использованием имущества осуществляются путем проведения проверок в следующих формах: выездная; документарная; аудиторская.

По результатам проверки Департамент по управлению государственным имуществом Ханты-Мансийского автономного округа - Югры принимает решение о направлении материалов проверки в суд, органы прокуратуры или иные органы, если в результате проверки получена информация о нарушении законодательства Российской Федерации, содержащем признаки противоправного деяния.