В связи с упразднением Федерального агентства по сельскому хозяйству и передачей его функций Минсельхозу России внесены соответствующие изменения в Правила осуществления государственных закупочных и товарных интервенций для регулирования рынка сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия. В частности, уровни цен, при достижении которых проводятся государственные закупочные и товарные интервенции, определяются Минсельхозом России по согласованию с Федеральной службой по тарифам. Также Минсельхозом России определяются объемы государственных закупочных и товарных интервенций.

Внесены изменения в отдельные распоряжения Правительства РФ, в соответствии с которыми функции заказчика подпрограммы "Энергоэффективность в сфере потребления", входящей в состав программы "Энергоэффективная экономика" на 2002 - 2005 годы и на перспективу до 2010 года.", а также целевых программ "Социальное развитие села до 2010 года", "Комплексные меры противодействия злоупотреблению наркотиками и их незаконному обороту на 2005 - 2009 годы" переданы Минсельхозу России. Соответствующие обязанности перешли от Россельхоза к Минсельхозу России по выполнению мероприятий федеральной целевой программы "Сохранение и восстановление плодородия почв земель сельскохозяйственного назначения и агроландшафтов как национального достояния России на 2006 - 2010 годы".