Вопрос: Организация получает статус резидента Сколково в сентябре 2020 года и с 01 октября 2020 года в случае использования организацией основной системы налогообложения вправе использовать льготы по НДС согласно п. 1 ст. 145.1 и льготы по налогу на прибыль согласно п. 1 ст. 246.1 НК РФ.

Организация находится на упрощенной системе налогообложения.

Согласно п. 3 ст. 346.13 Кодекса налогоплательщики, применяющие упрощенную систему налогообложения, не вправе до окончания налогового периода перейти на иной режим налогообложения, если иное не предусмотрено ст. 346.13 Кодекса.

Вместе с тем п.4 ст. 346.13 гласит:

Если по итогам отчетного (налогового) периода доходы налогоплательщика, определяемые в соответствии со статьей 346.15 и подпунктами 1 и 3 пункта 1 статьи 346.25 настоящего Кодекса, превысили 150 млн рублей и (или) в течение отчетного (налогового) периода допущено несоответствие требованиям, установленным пунктами 3 и 4 статьи 346.12 и пунктом 3 статьи 346.14 настоящего Кодекса, такой налогоплательщик считается утратившим право на применение упрощенной системы налогообложения с начала того квартала, в котором допущены указанное превышение и (или) несоответствие указанным требованиям.

В октябре 2020 года организация теряет право на применение УСН в связи с тем, что доходы налогоплательщика превысили 150 млн рублей, и с 1 октября 2020 года обязана перейти на общую систему налогообложения.

В этом случае, если организация подала в ИНФС до 20 ноября 2020 года заявление и другие документы согласно п.п. 4, 7 ст. 246.1 о применении льгот, как резидент Сколково, имеет ли она право применять льготы по НДС и налогу на прибыль с 01 октября 2020 года, положенные резидентам Сколково?

Ответ: Департамент налоговой политики рассмотрел письмо о применении освобождения от обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой налога на добавленную стоимость и налога на прибыль организаций, организацией, получившей статус участника проекта по осуществлению исследований, разработок и коммерциализации их результатов в соответствии с Федеральным законом от 28 сентября 2010 г. N 244-ФЗ "Об инновационном центре "Сколково" (далее - участник проекта), и утратившей право на применение упрощенной системы налогообложения, и сообщает.

Положениями статей 145.1 и 246.1 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) предусмотрен порядок освобождения организации, получившей статус участника проекта, от обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой налога на добавленную стоимость и налога на прибыль организаций (далее - право на освобождение). При этом участник проекта вправе использовать право на освобождение с 1-го числа месяца, следующего за месяцем, в котором был получен статус участника проекта.

Таким образом, организация, в том числе утратившая право на применение упрощенной системы налогообложения, которая направила в налоговый орган по месту своего учета уведомление и документы об использовании права на освобождение по налогу на прибыль и налогу на добавленную стоимость, за период с 1-го числа месяца, с которого этот участник проекта начал использовать право на освобождение, налог на добавленную стоимость и налог на прибыль не исчисляет.

Согласно пункту 3 статьи 145.1 и пункту 4 статьи 246.1 Кодекса участник проекта, начавший использовать право на освобождение, должен направить в налоговый орган по месту своего учета письменное уведомление и документы, подтверждающие статус участника проекта и предусмотренные Федеральным законом от 28 сентября 2010 г. N 244-ФЗ "Об инновационном центре "Сколково", не позднее 20-го числа месяца, следующего за месяцем, с которого этот участник проекта начал использовать право на освобождение.

Настоящее письмо не содержит правовых норм или общих правил, конкретизирующих нормативные предписания, и не является нормативным правовым актом. В соответствии с письмом Минфина России от 7 августа 2007 г. N 03-02-07/2-138 направляемое письмо Департамента имеет информационно-разъяснительный характер по вопросам применения законодательства Российской Федерации о налогах и сборах и не препятствует руководствоваться нормами законодательства о налогах и сборах в понимании, отличающемся от трактовки, изложенной в настоящем письме.